按月份分類
一月
炎熱潮濕，午後有雷暴
氣溫高達30°C以上，濕度令人難受。下午三點後經常打雷暴雨，海面翻湧影響船班往來各島。潛水能見度降至15米以下，不適合浮潛新手。
二月
雨季高峰期，降雨量大
全年降雨量最高的月份，連續數天暴雨常見。穆察穆杜老城石板街積水嚴重，泥石流風險令Karthala火山登山道封閉。機場航班經常因天氣取消。
三月
仍然潮濕，但降雨量逐漸減少
雨勢開始減弱但仍不穩定，一星期約下雨四至五天。海水溫度達28°C，但浪湧未平息。住宿價格比旺季便宜三成，遊客稀少。
四月
過渡到乾季，偶有陣雨
天氣過渡期，早上通常晴朗但傍晚可能突然下雨。開齋節期間當地餐廳營業時間混亂，日落後街頭才熱鬧。海況逐漸改善，部分潛點重新開放。
五月
舒適乾季開始
乾季正式展開,日照時間增至每天八小時。氣溫回落至27°C左右,濕度明顯下降。這時候預訂莫黑利機場航班較容易確認,但酒店開始加價。
六月
涼爽乾燥，海面平靜
印度洋東南季候風帶來涼爽乾燥天氣，白天只需28°C。海面如鏡,適合初學者潛水。Mitsamiouli海灘的海龜開始產卵,但觀察活動需提前兩週預約。
八月
全年最佳天氣
全年最舒適的月份,氣溫維持在26°C、幾乎無雨。水下能見度可達40米,是拍攝座頭鯨的黃金時機。機票和住宿達到年度最高價,背包客旅館床位也需預訂。
九月
乾燥溫暖，能見度優越
先知誕辰令整個群島進入節慶氣氛,街頭有傳統音樂表演。天氣依然乾爽,能見度維持在30米以上。遊客開始減少,酒店願意提供折扣但仍需議價。
十月
炎熱乾燥，雨季前的準備期
氣溫重新爬升至30°C,空氣變得悶熱。雖然仍屬乾季但雲層增厚,日照減至六小時。香草採收季節令昂儒昂島農戶忙碌,部分民宿暫停接客。
十一月
雨季開始，濕度上升
雨季頭一個月,濕度急升但暴雨尚未頻繁。海面開始不穩,快艇往莫黑利島班次減半。是預訂長期住宿的好時機,月租公寓價格可低至旺季四成。
十二月
潮濕炎熱，經常下大雨
每週至少五天下大雨,瀑布水量暴增但道路泥濘難行。聖誕假期歐洲遊客仍會來訪,但多數時間困在酒店。潛水店大多休業維修設備,部分餐廳也暫停營業。
海灘和游泳
Chomoni海灘的黑沙在七至九月最適合游泳，這時海浪平靜、水溫舒適在27°C左右。一月至三月的雨季令海水混濁，而且午後雷暴隨時出現，千萬別在下午三點後下水。大科摩羅島西岸的海灘多為火山岩岸，沙質海灘集中在昂儒昂島，但那邊的渡輪在十一月後經常因天氣停航。注意所有海灘都沒有救生員，當地人普遍不諳水性，別指望有人救援。
潛水和浮潛
六月至九月是潛水黃金期，Mitsamiouli海洋保護區的鯊魚、魔鬼魚幾乎每潛必見。莫洛尼僅有三間持PADI認證的潛店，單次船潛收費€60，比塞舌爾便宜一半但設備老舊。雨季期間（十二月至三月）大部分潛點因浪湧關閉，即使開放能見度也低於10米，根本看不清珊瑚。莫黑利島南端的沉船點水深僅18米適合進階開放水域潛水員，但洋流強勁，別高估自己能力。八月中旬後座頭鯨開始南遷，運氣好可在水下聽到鯨歌，但禁止追逐或觸摸。
登山和火山
Karthala活火山海拔2361米，從登山口到火山口需時七小時，必須在乾季（六至十月）攀登，雨季時山徑因泥石流完全封閉。嚮導費用每人€80（最少兩人成團），雖然昂貴但山上無路標且火山噴氣孔位置會變動，自行上山極度危險。出發時間通常是凌晨兩點，目的是在日出前登頂避開正午高溫，務必帶足四公升飲水。莫黑利島的Ntingui山只需三小時來回，不用嚮導也可應付，但山頂觀景台在十一月至三月被雲霧遮蔽，什麼都看不見。別穿新登山鞋，火山岩會在一天內刮爛鞋底。
平價旅遊
每人每天預算可壓至€35，前提是住民宿（€12一晚）、吃路邊烤魚配木薯（€3一餐）、只搭當地人用的小巴（島內任何距離€1）。七至八月旺季期間這預算不可能達成，最便宜的單人房也要€25起跳。在穆察穆杜老城的雜貨店買法棍麵包和罐頭吞拿魚自己解決早餐，比酒店的€8早餐划算。避開持信用卡的餐廳，它們向遊客收費比當地人貴三成，選那些只收科摩羅法郎現金的小店。莫洛尼機場的銀聯提款機經常故障，務必在抵達前換好足夠現金，市區找換店匯率比機場好15%。
